NotifyIcon al arrancar aplicación

[Trulala de cordoba]

Hola.
Si, te va a dar ese problema al iniciar porque no es lo mismo lo que sucede cuando haces clic en la aplicación que cuando la ejecutas de otra forma. Lo que vas a tener que hacer es ejecutarla al inicio pero llamando a una linea de comando, lo que no recuerdo cual era el parametro para esto creo que era así:
"myProgram.exe /w"

o en vez de w poner i:

"myProgram.exe /w"