Hola:
Para javascript, php no es dinámico... cuando php genera el código, javascript no existe y viceversa, así que lo generado en php, en el navegador deja de ser dinámico...
Así como creas los campos en php, puedes crear las referencias... hay muchos mensajes en estos foros sobre pasar variables de php a javascript, si nos indicas lo que tienes hecho, será más fácil poder ayudarte.
Saludos
