Ya he dado solución a mi problema, a continuación pongo mi solución para si alguien al igual que a mi se le hace necesario:
Cita: <html>
<head>
<title>Formulario checkboxes</title>
<script>
function seleccionar_todo(){
for (i=0;i<document.f1.elements.length;i++)
if(document.f1.elements[i].type == "checkbox")
document.f1.elements[i].checked=1
}
function deseleccionar_todo(){
for (i=0;i<document.f1.elements.length;i++)
if(document.f1.elements[i].type == "checkbox")
document.f1.elements[i].checked=0
}
</script>
</head>
<body>
<form name="f1">
Nombre: <input type="text" name="nombre">
<br>
<input type="checkbox" name="ch1"> Opcion 1
<br>
<input type="checkbox" name="ch2"> Opcion 2
<br>
<input type="checkbox" name="ch3"> Opcion 3
<br>
<input type="checkbox" name="ch4"> Opcion 4
<br>
Otro campo de formulario:
<select name=otro>
<option value="1">Seleccion 1
<option value="2">Seleccion 2
</select>
<br>
<input type="submit">
<br>
<br>
<a href="javascript:seleccionar_todo()">Marcar todos</a> |
<a href="javascript:deseleccionar_todo()">Marcar ninguno</a>
</form>
</body>
</html>
Tomado de:
http://www.desarrolloweb.com/articulos/2291.php