otra cosa no necesitas crear un conteo para los array puedes hacerlo de esta forma
Código PHP:
$buzon1=mysql_query("select * from permisos WHERE codigo_empresa like'$codigo' and nombre_usuario like '$usuarios1'", $link);
echo mysql_num_rows($buzon1);
//dime si te sale un valor que no sea 0
while($listabuzon1=mysql_fetch_assoc($buzon1)){
$codigobuzon[] = $listabuzon1['buzon'];
}