Código .haccess:
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RewriteEngine on
RewriteRule ^index/([^-]+) /index.php?ar=/new/Btmh&me=- $1
Creo que con eso ya te va a andar...tene en cuenta que si por ejemplo, la forma de incluir los css que usas es: css/style.css ahora va a intentar leer los css dentro de las carpetas index/bmth (la cual no existe) asique te va a dar error, vas a tener que actualizar todos los vinculos tmb.
No entiendo muy bien lo que queres hacer, pero me imagino que con eso ya se te soluciona el problema del .htaccess.