GatorV, primero muchas gracias por contestar, el código resultó perfecto, pero ahora me surgió otro problema, lo quise implementar en otro código que tengo y me guarda solamente un 0, te posteo el código completo
   Código PHP:
   
function GuardarContadores($contsx,$cm1,$cm2,$ch1,$ch2){
    $fp = fopen("contadores2.php","w");
    $str = "<?
// Contador de usuarios segun su sexo
$contsx=array($contsx[0],$contsx[1],$contsx[2]);
// Contadores de estadisticas
$cm1=array(";
    $str = $str + sprintf("array(%s,%s,%s));n$cm2=array(",$cm1[6][0], $cm1[6][1], $cm1[6][2]);
    fwrite($fp,$str);
    fclose($fp);
 
    print_r($cm1);    
  :S