Dudo que microsofot aplique su api al sistema de Linux, ya que su API no se basa en C como la del kernel de Linux, lo que te puedo asegurar es que a partir del 2004 Microsoft comenzara a crear aplicaciones servidor para plataformas Linux, ya que para el 2007 se prevee que Linux este en mas del 50% por ciento de servidores. (lei una noticia sobre ello, creo que fue en Barrapunta.com).
Por mi parte ... si microsoft mete mano a Linux .... con tal de que sea OpenSource no me importaria ya que todo lo que llege a la comunidad GNU/Linux es bueno
jeej y sino siempre tendremos GNU/Hurd