Hola, ¿qué tal?
 
Te recomiendo si es imperioso que instales vista o xp, pruebes GParted, permite formatear unidades darle formato ntfs, fat, todos los sistemas de linux, es booteable y muy compatible.  
http://gparted.sourceforge.net/livecd.php 
Demás está decir que hagas un backup de tus archivos y primero formatees la unidad, reinicies y recién en ese momento le des formato, ya sea ntfs, fat, etc. 
Espero tus comentarios, un cordial saludo.