Ese error te indica que dentro de la consulta estas llamando a dos tablas que tienen ese valor... por lo tanto verifica cual es el que quieres poner en el filtro y de que tabla es y agregale el nombre de la tabla adelante... como esto:
Código:
SELECT campo1, campo2
FROM tabla1 NATURAL JOIN tabla2
WHERE tabla1.id = tabla2.id
Por decir algo no mas... pero se entiende donde va el nombre de la tabla :D
Suerte!