Cita:
Iniciado por after 
o.O
No
un .exe ningún servidor lo ejecuta. Los .exe son para ejecutarse en windows, no para servicios, servidores web. Son programaciones distintas.
Si se pueden ejecutar los .exe en linux hehehe.
Lo que yo te recomiendo es que pues los suban en zip, aunque si solo son para descargar no veo por que los vayan a "ejecutar".