Debes hacer peticiones (GET o POST) para que PHP lo pueda leer. Acuérdate que PHP corre en el servidor, no en la computadora del cliente. Podrías usar peticiones asincrónicas (con AJAX) o simplemente enviar la petición por ejemplo por medio del método GET, algo como
Código HTML:
Ver original<a href="foo.php?bar=candy">foo
</a> <a href="#" onclick="window.location='foo.php?bar=candy'; return false;">foo
</a>
Luego en PHP lo lees con la variable $_GET y al final muestras el resultado que quieras.