Partition Table Doctor es una gran eleccion para reparar particiones dañadas, con problemas, sector de arranque, MBR..
Prueba este software y comprueba como reacciona la unidad.
También podría reparar el MBR del S.O Windows 7 y comprueba si iniciar de forma correcta.
Cita: Reparar el master boot record
Si desea restaurar el registro de inicio maestro, sólo tiene que escribir el siguiente comando:
bootrec /fixmbr
También puede escribir un nuevo sector de inicio en la partición del sistema con este comando (que a menudo es más útil):
bootrec /fixboot
bootrec /rebuildbcd
Sustitución del gestor de arranque de Windows XP con Windows 7
Si es que instalaron XP en la misma PC que ya tenía Windows 7, se darán cuenta de que no pueden volver a arrancar Windows 7. Puede utilizar este comando para arreglarlo y restaurar el gestor de arranque de Windows 7:
bootsect /nt60 all
Otra opcion es reparar el inicio del S.O con el mismo Cd de instalación
http://www.youtube.com/watch?v=zWPpnALv9PE