problema incluyendo jquery en archivo .js

[Ale_VH]

Buenas a todos,
tengo un problema y es que tengo una pagina, en php, dentro de la misma hay un enlace a un archivo css y otro a un archivo js. al principio funcionaban bien, de hecho siguen funcionando, pero al agregar jquery en el archivo de js no lo detecta, y no sé como hacer para que lo haga. probe poner el codigo en la pagina misma (donde, dicho sea de paso, esta enlazado el archivo jquery.js) y funciona, pero cuando quiero separarlo no va. supongo que es porque no enlazo el archivo jquery.js con el archivo .js que contiene el codigo que yo escribo de jquery. en fin, alguien tiene alguna idea que que puede estar fallando??? o como hacer para que el archivo js detecte el codigo jquery? gracias!!!