Cambio de disco de arranque en 2003 Server

[jose_cab]

Por favor, es muy muy urgente. Tengo un Windows server 2003 parado en la empresa.
Tenía un RAID 5 letra C: con el sistema instalado y arrancaba bien. Por problemas del software tuve que instalar otro RAID 1 letra E: donde instalé el nuevo sistema 2003 server, árbol de directorio y Exchange y traspasé datos desde la C: la cual finalmente quedó inutilizada.
Al arrancar el server arrancaba con la instalación de la letra E: (Pero el boot lo cogía de C: )
Ahora hemos eliminado el RAID 5 y el RAID1 se ha convertido el solito en C: pero lógicamente no arranca.
He revisado y no tiene boot.ini ni nada. (Al parecer estaba en el RAID 5 en la antigua C: )
He vuelto a montar otro RAID5 y éste pasa a ser la E: en el que he instalado un nuevo 2003 Server, el cual arranca perfectamente y ha creado los boot.ini, etc… Pero claro, no puedo arrancar el sistema que me interesa con Exchange.
La idea es pasar el sistema de arranque al otro disco RAID1 y volver a eliminar el RAID5, alguien puede ayudarme. No puedo perder la configuración existente en el otro disco.