tienes en tu tabla
 
tabla alumno   
Código PHP:
Ver original------------------------------------
idalumno|idmateriasdebe
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1             | 2,12,44
2             |4
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no se si en una sola consulta se pueda hacer, pero con dos si 
por ejemplo traes los datos del alumno 1  
 Cita:  $sql="select idalumno,idmateriasdebe from alumnos where id=1";
$res mysql_query($sql);
$datos=mysql_fetch_array($res);
    despues haces un explode por tu separador (en tu caso la coma), y realizas una consulta pro cada resultado 
$materiasdebe=explode($datos[1]); 
for($i=0;$i<=count($materiasdebe);$i++)
{
$sqlmaterias="select nombremateria from materias where idmateria='$materiasdebe[$i]'";
$resmateria=mysql_query($sqlmaterias);
$datonombremateria=mysql_fetch_array($resmateria);
echo "Materia ".$datonombremateria[0] ."<br>";
}