Cita: a ir llenando una base de datos remota a traves de una local, una solucion que se me ocurre es en la base de datos local no tener ninguna clave primario asin una vez haga la importacion en la base remota esta ya me creara una clave primaria auto increment, en resumen si lo que pretendo hacer lo empiezo de cero que manera es la correcta de hacerlo.....
Eso funcionaría con tablas que no posean FK, o con aquellas donde los datos exportados no existan ya en la base destino. En cualquier otro caso se generarán problemas de integridad referencial y de redundancia nociva.
Debes planear para el peor escenario, siempre. Jamás se planifica para el mejor caso, porque el mejor caso casi nunca se presenta, en cambio los peores si, y tienes que ser capaz de controlar la contingencia.