Mmm.. nunca trabaje con Shadowbox, pero intenta poner el código de tu galería de imágenes dentro del modal que te acabo de pasar, debería funcionar.. ya lo he probado hasta con videos y funciona perfecto.
Llama a la librería con este código , no tenes que descargar nada.
Código HTML:
<script src="http://code.jquery.com/jquery-latest.js"></script>
Solo para salir de la duda de si la librería que estás usando es la que esta causando el problema.