Hola xfx, disculpame pero me olvide de poner solucionado en el anterior, esta en un servidor en mi pc, mismo dominio, hice como me dijiste antes, saque el index.php y puse los archivos de la otra web y el index.html, con eso quedo solucionado. Ahora a esta web, la del contador, le agregue el register.php, y lo llame con un link asi:
Código PHP:
<div class="bottom-text">
<ul>
<li>
<a id="register" href="register.php">Registro</a>
</li>
</ul>
</div>
tengo los otros 2 botones con mismo div class