Exacto, el segundo console.log nunca se va a imprimir por que el return termina la lectura de las siguientes instrucciones que pongas bajo el.
La mejor forma de hacerlo sería pasar la variable precio final antes del primer if, y luego quitar el return preciofinal de todas las condiciones, luego despues de todas las instrucciones que tengas en este caso el segundo console.log retornar el valor precioFinal...
Éxitos!
