Consultar registros duplicados en dos bases de datos distintas

[arts]

No se si lo he entendido, pero para acceder a 2 bd distintas ya de por si necesitas 2 conexiones diferentes, si ademas se encuentran en diferentes maquinas o ip, necesitas un webserice para conectarte desde php u otro lenguaje. Con acceso a esas bd ya puedes hacer las consultas que quieras.