Cambio de archivos para pagina web

[alfonsofivimar]

Buenas, mi duda es la siguiente, estoy desarrollando una web para mejorar la existente con Prestashop. En los archivos de la web antigua que están subidos a mi hosting he creado una nueva carpeta llamada "Desarrollo" y ahi estoy metiendo todos los archivos de la nueva web. Mi consulta se debe a que cuando termine de desarrollar esa web, puedo sin ningún problema borrar todos los archivos de la anterior pagina y moverlos a la raiz principal de mi dominio sin ocasionar problemas ? me refiero por el tema de rutas etc que cambiarian etc .. estoy comenzando con este mundo del desarrollo web y no estaría mal saberlo antes de que pueda avanzar mas con ella .. Saludos !!:)