SQL Server tiene un único
motor de tablas (el segmento del kernel que administra las tablas físicas en el disco); lo mismo pasa con Oracle, DB2, y PostgreSQL.
Pero MySQL es mucho más flexible, y cuenta con varios motores de tablas diferentes, entre ellos
InnoDB (usualmente es el por default), pero también MyISAM, BDB, Federated, Merge, Archive, y varios más.