Holas,
Desconosco la distro que usas pero creo que sed necesita un parametro mas despues de la expresion es el archivo o path por ejemplo:
Código BASH:
Ver originalsed /s/\t/,/g /ruta/del/archivo > /ruta/de/la/respuesta
Y que error te muestra o te resulta?
Si no envias ningun parametro adicional desde php al comando system puedes juntar toda esa cadena en un bash y luego solo desde PHP llamar a ese bash.
Ya nos confirmas.
Saludos,