Hola
Estoy más o menos igual que tu, también uso Qt para mis proyectos personales y de mi trabajo, pero no trabajo de programador ni programo para el público, todo lo que hago es privado para mi.
Qt es un frameworks enorme, tiene para todo XD. Dispone de la clase
QSettings para guardar datos de configuración. Es lo que yo uso.
Otra opción, que estoy usando en un proyecto en curso, es guardar la configuración del programa dentro de la propia base de datos, para eso creé una tabla con dos campos clave/valor de tipo texto en el que guardo todos los datos que necesita el programa. Obvio que la configuración para acceder a la base de datos no la puedes guardar ahí XD, para eso el QSettings.
Si los datos son sensibles, siempre puedes encriptarlos antes de guardarlos.
También puedes usar un archivo de texto plano que puedes leer desde tu programa,pero para mi es mucho más práctico QSettings.
Un saludo