Mira te comento con un disco de inicio del sistema operativo, ya que podrás decirle a un compañero de windows 98 que te cree uno.
Una vez en el ms-dos veras.
C:\>
y le pones
CD\carpeta_temp\ ---->> El nombre que desees eliminar la carpeta
y borramos sus archivos
del .
salidmos de la carpeta
cd\
y borramos la carpeta
rd carpeta_temp ------> El nombre que desees eliminar la carpeta
y ya estará totalmente borrada.
Saludos