Hola hola...
bueno les cuento que ya le di solución...
simplemente en el popup
hago todo lo que necesite ahi en php y en el momento de grabar y querer cerrar.. simplemente pongo esto en el boton..
<input name="Aceptar" type="submit" alt="Aceptar" onclick="opener.location.reload();window.close()"/>
y ya funciona bien!!!
un saludo!!