Supongo que usas el TMPGEnc ¿no? En tal caso, parece que es un error del programa. Mira este post, es lo mismo:
http://www.forosdelweb.com/s/msg180253.html
El TMPGEnc parece que da muchos problemas a la hora de hacer CVCD, por ello para este formato recomiendo otro programa, el Canopus Procoder.
Sin embargo el TMPGEnc hace los VCD perfectos
