más o menos voy entendiendo lo que necesitas pero lamento informarte que con perl eso no se puede hacer
por eso es que usan javascript, para refrescar el banner de propaganda sin que se refresque la página entera...entonces PERL no te servirá de mucho...Pero Este mensaje cabría mejor en el foro de JavaScript!!!!! que es el lenguaje con el cual hicieron ese script
Otra opción podría ser FLASH, ya que te permite hacer animaciones entre banner y banner
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Un Abrazo
MonoSwim