Cierto, si no planeas bien la distribucion a veces puedes generar turbulencia que sea contraproducente.
Lo que comentas de varia el voltaje a los ventiladores es mas comun de lo que imaginas, le sueln llamar FanBus o ReoBus, en una bahia de 3 1/2 o 5 1/4 acomodas las perillas y tu maquina parece tablero de avion (hay quien hasta coloca pantallas de LCD).
Lo mas insano que he visto es:
1 procesador
1 12cms frente del gabinete
2 6 cms. atras del gabinete
1 8 cms. arriba del procesador (aparte del incluido, recortaron la tapa)
1 12 cms. arriba, entre fuente de poder y cdroms (tambien agujeraron)
1 north bridge
1 t. de video
1 fuente de poder
Jejeje, pero por supuesto que la maquina esta bien fria. Pero si a esas vamos mejor le montas un watercooling.
Si quieres seguir investigando empieza por
www.overclockers.com, www.ocmexico.com, www.gruntville.com o en google con la palabra "modding"