Mira, algunas motherboard viejitas, no soportan el reconocimiento de CD-ROM. Si vas a instalar un win98, utiliza el diskette de boot ya que este trae varios controladores para reconocer CD-ROM. Si no tenes dicho diskette, podes obtenerlo de
BootDisk.
Ahora, si sacas el HD para pegarlo en otro equipo, instalar luego el 98 y después volver a conectarlo en el equipo original, te va a dar muchos fallos porque el 98 o cualquier wintendo se configura con las caracteríasticas de hardware del equipo. En ese caso podes pegar el HD como esclavo en otra PC, luego iniciar, después copiar la carpeta que dice win98 del CD al HD, luego quitarlo, después conectarlo como maestro en la PC original, iniciar con cualquier diskette de boot, pasarte a C, luego al directorio win98 y ejecutar desde ahí instalar o setup (depende si es en inglés o español).