Hola Luisa
Mira, puedes usar el viejo truco de arrastrar a la carpeta que quieras, pero hay una forma mejor que te evitará molestias y posibles errores con el tiempo.
Imagino que tendrás una carpeta para guardar las bases de datos, otra en donde guardarán los logs del servidor.... y una, es el directorio público. Tal vez se llame www o html o http_docs.... supongamos que la carpeta en donde hayas de guardar las cosillas se llame
pepe
ok, en las opciones de configuración del servidor remoto fíjate que hay una opción que se llama "Directorio del servidor". ok, pues ponle pepe. De esa forma al entrar en tu sitio remoto entrarás directamente a ese directorio
