Hola yo tambien soy programador de php(3 años) y lo que queres hacer en asp.net como en phpnuke no es viable en este tipo de lenguajes. Las app del .net son compiladas y en php son interpretadas, lo cual insertar un script al medio(require, include) para que el interprete lo tome todo junto no es una buena opcion en .net. El uso de controles es una solucion, pero un poco pesada porque hay que meter controles en todos lados... lo mejor (y que va a estar en asp.net 2.0) son las master pages, hay varias versiones en .net 1.1 gratuitas.... podes ver una en
http://www.metabuilders.com/Tools/MasterPages.aspx
Saludos