Bueno, siempre puede mandar tres mysql_query, uno para cada tabla y quedarte con el resultado.
De todas formas si hay una manera de obtener las tres cuentas en una única consulta, que te devolverá tantas filas como tablas.
Código:
select "tabla1", count(*) from tabla1
union
select "tabla2, count(*) from tabla2
union
select "tabla3, count(*) from tabla2
Esto te devolverá tres filas, una por cada select y cada una con el número de filas de cada tabla.
Un saludo.