problema con conexiones a base de datos

[kurlax]

A ver, dudaba entre colocar esta duda en este foro o el de mysql, pero que decida el administrador.
La custion es que tengo un sistema de banners echo con PHP, ADOdb y Mysql
Cuando alguien ve un banner de los que ofrece mi servidor anoto el acceso a ese banner en la base de datos, claro como tengo mogollon de accesos esto me genera bastantes conexiones simultaneas a la base de datos hasta que me da un error que viene a decir esto:
El usuario Apache a excedido el numero de conexiones permitidas a la base de datos valor actual 1000
He revisado la configuracion del MySQL y tanto el max_connections como el max_user_connections lo tengo a 3000, entonces por que leñes me dice que current value=1000
no encuentro un 1000 por ningun sitio en la configuracion.

He visto que existen conexiones persistentes (Se quedan abiertas esperando a que llegue otra conexion) y no persistentes (Se cierran) esto en en ADOdb-php se distingue estableciendolas con Connect y PConnect respectivamente y yo las abro no persistentes(Para que se cierren cuando hago Close)

Si alguien a tenido este problema alguna vez por favor que me eche una mano, que ya no se que hacer.

Muchas gracias de antemano.