Creo que eso pasa porque al hacer click para imprimirla el foco es en la ventana madre.
Lo arreglás con esta función:
<script language=javascript>
<!-- empieza
function imprimepopup(){
nombredelaventana.focus();
nommbredelaventana.print();
}
termina -->
</script>
y luego una cosa así
<a href="javascript
:imprimepopup();">Imp rime la Ventana</a>
No estoy seguro si se llama el foco a la ventana de la forma que te dije y en este momento no puedo probar, pero seguro que si buscas por ahí va a andar.
ORA ET LABORA
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