Hola FuLaNo_:
Supongo que con el body del popup podrías conseguir tu objetivo:
<body onload="setTimeout('window.close()', 3000)" onunload="opener.principal.loaction.href = 'nuevoEnlace.html'" >
Para el ejemplo, ha usado 3 segundos (3000 milisegundos) y en el sistema de frames debes cambiar "principal" por el nombre del frame donde quieres enlazar un nuevo archivo, que en el ejemplo es "nuevoEnlace.html"...
Saludos
