Lo de monitorizar una base de datos depende más que nada del vendedor de la base de datos, si él te lo permite entonces si que puedes monitorizar todo lo que él te deje. También puedes usar el conector JDBC-ODBC para monitorizar, pero a no ser que te sea realmente imprescindible yo no te recomiendo que lo uses, ya que este conector ODBC es lento a más no poder, y te va a ralentizar todos los accesos/actualizaciones a tus bases de datos. Pero si tus codigos están actualizando la base de datos no necesitas monitorizarla. Generalmente se monitoriza algo (base de datos, LDAP, accesos HTTP) cuando tu no lo invocas directamente. No sé si me explico bien, osea cuando alguien está actualizando tus bases de datos desde fuera de tu control.
Y lo del email usando Java yo uso JavaMail y me va muy bien. Puedes bajartelo en el sitio de java de Sun:
www.java.sun.com