Hola j.ruiz,
No he desarrollado nunca una aplicación directamente en Access, ya que solo uso Access como base de datos, y las aplicaciones las programo en otro entorno pero, ¿puedes poner rutas relativas?, es decir, si por ejemplo tienes la base de datos en el mismo directorio que la web pondrías ".\base.mdb", o si tienes por ejemplo en el raíz la base de datos y la página en un directorio que cuelga del raíz "..\base.mdb".
Si puedes, es una posible solución a tu problema,
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Salu2.