Solo como una recomendacion seria que instalaras otro disco duro con un sistema operativo y reiniciaras con el para poder respaldar toda tu informacion.
Despues de los prosedimientos que mencionaste creo que seria algo dificil que pudieras reiniciar bien tu pc, aunque no esta demas reinicar con un boot disk de un buen ativirus y verifiques tu todos tus archivos.
En lo personal hace tiempo probe windows millenium y despues de un parde dias ya no quize saber nada mas de el.
saludos...