Que onda!!!
Mira lo hice de dos formas, puede ser con el indice, o bien con el value del select, que asi es como tu lo pedias comparado con una "S", pega este codigo en un HTML pa que veas como funciona y de ahi me dices si es lo que buscas, ok
<body>
<form action="principal.html" name="frm">
<select name="car_form" onChange="if (document.forms['frm']['car_form'].selectedIndex == 2) {document.forms['frm']['id_sector'].value=''}">
<option value="" selected><Seleccione></option>
<option value="R">Regional</option>
<option value="S">Sectorial</option>
</select>
<input name=id_sector type=text value=$GET[idsec_actual]>
</form>
<form action="principal.html" name="frmv">
<select name="car_form" onChange="if (document.forms['frmv']['car_form'].value == 'S') {document.forms['frmv']['id_sector'].value=''}">
<option value="" selected><Seleccione></option>
<option value="R">Regional</option>
<option value="S">Sectorial</option>
</select>
<input name=id_sector type=text value=$GET[idsec_actual]>
</form>
</body>
Saludos
y suerte
Chao