Revisa
este mensaje de un experimento que hice hace unos meses. Ahi viene una sonda térmica, que es justamente lo que tu tienes.
Por lo regular se ponen:
1) pegados abajo de la tarjeta y procesador (justamente en el lado contrario al disipador.
2) entre el micro y la base, pero requiere de una sonda muy delgada, o bien, modificar la base para permitir el paso del cable.